(2547 Sayılı Kanunun 7/d-2 maddesi uyarınca kurulan merkezler)

• B.U.Ü. Arıcılık Geliştirme Uygulama ve Araştırma Merkezi (AGAM)
• B.U.Ü. Arkeoloji Araştırmaları Uygulama ve Araştırma Merkezi (ARAM)
• B.U.Ü. Atatürk İlkeleri ve İnkılap Tarihi Uygulama ve Araştırma Merkezi
• B.U.Ü. Balkan Uygulama ve Araştırma Merkezi (BALKAM)
• B.U.Ü. Bilgi İşlem Uygulama ve Araştırma Merkezi
• B.U.Ü. Bilim ve Teknoloji Uygulama ve Araştırma Merkezi
• B.U.Ü. Bitki Islahı ve Tohum Teknolojileri Uygulama ve Araştırma Merkezi (BUTOM)
• B.U.Ü. Bölge Kaynaklarının Araştırılması ve Değerlendirilmesi Uyg. ve Araş. Mrk.
• B.U.Ü. Enerji Bilimleri Uygulama ve Araştırma Merkezi
• B.U.Ü. Eklemeli İmalat Uygulama ve Araştırma Merkezi 
• B.U.Ü Farabi Türk İslam Düşünce Tarihi Uygulama ve Araştırma Merkezi
• B.U.Ü. Fizyoterapi ve Rehabilitasyon Uygulama ve Araştırma Merkezi
• B.U.Ü. Garbiyat Çalışmaları Uygulama ve Araştırma Merkezi (BUGAMER)
• B.U.Ü. Kadın ve Aile Çalışmaları Uygulama ve Araştırma Merkezi (UKAM)
• B.U.Ü. Karagöz ve Kukla Oyunları Uygulama ve Araştırma Merkezi (KARAKUM)
• B.U.Ü. Kariyer Uygulama ve Araştırma Merkezi (KARMER)
• B.U.Ü. Kent Tarihi ve Araştırmaları Uygulama ve Araştırma Merkezi (KETAM)
• B.U.Ü. Malzeme Bilimleri Uygulama ve Araştırma Merkezi (MUAM)
• B.U.Ü. Mozaik Araştırmaları Uygulama ve Araştırma Merkezi (UMAM)
• B.U.Ü. Özel Eğitim Uygulama ve Araştırma Merkezi (ÖZAUM)
• B.U.Ü. Sağlık Uygulama ve Araştırma Merkezi (SUAM)
• B.U.Ü. Sürekli Eğitim Uygulama ve Araştırma Merkezi (ULUSEM)
• B.U.Ü. Tarımsal Uygulama ve Araştırma Merkezi (TUAM)
• B.U.Ü. Türk Devletleri ve Akraba Toplulukları Uygulama ve Araştırma Merkezi (TÜDAM)
• B.U.Ü. Türkçe Öğretimi Uygulama ve Araştırma Merkezi (ULUTÖMER)
• B.U.Ü. Uzaktan Eğitim Uygulama ve Araştırma Merkezi(ULUUZEM)
• B.U.Ü. Üniversite-Sanayi İşbirliğini Geliştirme Uygulama ve Araştırma Merkezi (ÜSİGEM)
• B.U.Ü. Dijital Dönüşüm ve Eğitim Uygulama ve Araştırma Merkezi (DİJİMER)

         (2547 Sayılı Kanunun 14. maddesi uyarınca kurulan merkezler)

• Ekonometri ve İstatistik Araştırma Merkezi (EKOMER)

• Diğer Merkezler